电子病历系统以电子化方式记录患者就诊的信息。
医疗信息化的精髓在于电子病历。电子病历系统以电子化方式记录患者就诊的信息，包括首页、病程记录、检查检验结果、医嘱、手术记录、护理记录等，其中既有结构化信息，也有非结构化的自由文本，还有图形图像信息，可以将患者历次在医院诊疗过程的信息全部记录下来，并能够针对这些数据进行后期的处理、查询和统计。
中信建投研究员吕江峰解释称，电子病历系统的应用以及共享，能提高医疗工作效率和工作质量，降低医疗事故发生概率。电子病历数据能够应用临床科研和药品研究需要。当前，世界各国对电子病历建设都极其重视，美国、日本、欧洲对电子病历建设均进行了大量投入。2009年美国通过的经济复兴法案即包括10年190亿美元在电子病历领域的投入，目前的估计是实际投入将达270亿。英国政府则10年投入了55亿英镑做电子病历。
与美国相比，我国的电子病历建设进程相去甚远。按照美国医院临床系统电子病历评估标准，医院电子病历应用情况由低到高划分为0到7级：0级为未形成电子病历系统；1级是部门内初步数据采集；2级可以进行部门内数据交换；3级不仅做到部门间数据交换，还可以进行初级医疗决策支持；4级则全院信息共享，中级医疗决策支持；5级可以进行统一数据管理，各部门系统数据集成，基本建立以电子病历为基础的医院信息平台；6级达到全流程医疗数据闭环管理，高级医疗决策支持；7级是完整的电子病历系统，可以在区域医疗信息共享。截至2012年，中国还未有一家医院能够达到标准评定的7级水平。吕江峰认为，基础医疗信息化的完善程度，是决定电子病历建设级别高低最为关键的因素。美国的电子病历建设从上世纪90年代开始已经过去20多年，现在仍然存在巨大的完善空间。
吕江峰介绍，电子病历的应用前景十分惊人。当数百万、千万的病历汇集在一起，运用大数据分析后得出的结论，医药公司和保险公司会视如至宝。美国公司Practice Fusion发掘的正是电子病历这座金矿，2013年9月，该公司已经拥有6500名患者的电子病历，累计融资1.3亿美元，估值高达7亿美元。2009年，为推进医疗改革，美国政府颁布法案规定：诊所中2015年前使用电子病历系统的医生，将会获得4.4万到6.4万美元的医疗保险奖金，反之，将要接受罚款。相较于其他电子病历系统提供商的高收费，Pactice Fusion的免费策略收到奇效，而其回报则是其系统生成病历的所有权。该公司很快得到大量医生用户的青睐，很多医疗公司开始在其系统上投放广告，2012年其广告收入已达到数千万美元。这一数额未来还有很大增长空间。
但是，真正的金矿是病历背后的大数据研究。对于医药公司以及研究机构来说，药品的临床效果、医生在开处方时的药品选择倾向以及近年来的健康趋势，都是研发以及销售最宝贵的资料。而每一种疾病与年龄、身体状况以及其他各种因素可能的关系，对于保险公司保单设计起着决定性作用。2013年1月，Practice Fusion上线了一个名为Practice Fusion Insight的收费产品，开始为医疗供应商、保险公司、医药公司和研究机构提供基于大数据的重要临床趋势和分析。
“一个商业模式成功的基础条件在于参与商业各方均能受益。Pactice Fusion公司的例子正是满足了这一条件。”吕江峰分析称，电子病历的有效使用，使得病人就诊效率提高，社会总体医疗费用降低，政府支出减小。医生由于使用电子病历得到政府奖励，公司通过提供广告和大数据分析从医药公司处获利，而医药公司依据大数据分析研制出更具疗效的药物，并通过投放广告而提高药物的销量，可谓一举多得。
